Действия происходят в 2015 году. За 15 лет до этого произошла страшная катастрофа - Второй удар, или глобальное потепление, погибло три четверти человечества, большая часть земли оказалась под водой. Секретная организация "NERV" создает огромную военную базу Токио-3, задача которой защита человечества от огромных таинственных "Ангелов"...